Desarrollo de un servicio avanzado de la farmacogenética clínicaintegración de abordajes genómicos y de tecnologías de la información

Resumen

Introducción: Los modelos disponibles de implementación farmacogenética con tecnologías de secuenciación de nueva generación, o NGS por sus siglas en inglés, Next Generation Sequencing, son escasos limitando su incorporación en procesos asistenciales. Hipótesis: Un abordaje farmacogenético integrando técnicas NGS, tecnologías de información y conocimiento clínico permite su aplicación asistencial. Objetivos: Desarrollar una plataforma farmacogenética NGS y una base de conocimiento para la implementación asistencial. Validación analítica y evaluación del desempeño clínico. Material y métodos: Se desarrolló un proceso de enriquecimiento por captura (SureSelect-XT, Agilent®) y secuenciación paired-end (Illumina®) junto con herramientas bioinformáticas y un repositorio de conocimiento para la interpretación de resultados genómicos. La validación analítica se realizó con muestras control de líneas celulares caracterizadas en múltiples plataformas farmacogenéticas. La evaluación del desempeño clínico se realizó en una cohorte de 395 pacientes con enfermedades reumáticas. Resultados: Se obtuvieron sensibilidades y especificidades analíticas >99%. Los individuos estudiados albergaron variantes de interés en un promedio de 5 de 20 genes analizados y una mediana de 34 fármacos por paciente (26% del total evaluado) que requerirían un abordaje terapéutico alternativo por su genotipo. Conclusiones: La plataforma desarrollada demostró unos parámetros de rendimiento analítico y desempeño clínico adecuados para su implementación asistencial. Además, se corrobora la importancia de la farmacogenética como herramienta de uso racional del medicamento.