Mechanisms of transcriptional regulation mediated by "IXR1" in yeast

Resumen

Ixrl es una proteína de Saccharomyces cerevisiae previamente relacionada con la respuesta a hipoxia y a estrés oxidativo, así como en la resistencia a cisplatino. El trabajo presentado en esta Tesis permite ampliar el conocimiento de los mecanismos de regulación mediante los cuales Ixr1 participa en estos procesos. Se realizaron experimentos de transcriptómica y localización de los sitios de unión de Ixr1 a lo largo del genoma y sus características. Los resultados mostraron que Ixr1 participa en la regulación de la asimilación de azufre y en el metabolismo de compuestos que contienen azufre, de aminoácidos de cadena larga y en diversas etapas de la biogénesis de ribosomas. La implicación de Ixr1 en el control energético de la célula es un factor indispensable para explicar la adaptación de la célula a los niveles de oxígeno o al daño producido por cisplatino. La caracterización bioquímica de Ixr1, acompañada de análisis funcionales de distintos motivos de la proteína, mostró que su unión al ADN se produce mediante los HMG-box en tándem, según un modelo secuencial con cooperatividad positiva. Además, las regiones que flanquean a los dominos de unión a ADN presentan un alto grado de desorden estructural V con tendencia a la agregación en forma de fibras amiloides, lo que sugiere la posibilidad de que Ixr1 pueda actuar como prion.