Estudio genético poblacional en la almeja babosa "Venerupis pullastra"

Resumen

La almeja babosa Venerupis pullastra constituye un importante recurso en la costa atlántica de la Penínsua Ibérica. Se explota directamente de bancos naturales pero también se cultiva para aumentar la producción y responder a la demanda del mercado. Sin embargo, los marcadores moleculares descritos y los estudios genéticos de poblaciones en esta especie son escasos. Este trabajo planteó desarrollar herramientas para la caracterización y evaluación genética del recurso y aportar datos que contribuyan a mejorar la gestión y conservación de las poblaciones naturales y los procedimientos de cultivo. Se desarrolló un panel de marcadores microsatélite (24 loci) y se optimizaron tres PCRs multiplex que amplifican cinco u ocho loci simultáneamente. También se desarrollaron cebadores para la amplificación de un fragmento del gen del citocromo b (CitB), ampliando las regiones mitocondriales dónde explorar la variación genética. Se analizó la diversidad genética de cinco localidades gallegas de diferentes rías (O Barqueiro, Barallobre, Camariñas, O Grove y Cangas) y una del sur de Portugal (Faro) en 18 loci microsatélite y en tres regiones mitocondriales, CitB y parte de los genes del ARN ribosómico 16S y la subunidad I de la citocromo c oxidasa (COI). La diversidad genética revelada por microsatélites fue similar en todas las localidades, pero los marcadores mitocondriales reflejaron oscilaciones destacables. Globalmente el nivel de diversidad genética es moderado, encontrándose en el rango o por debajo del descrito en otras especies de almeja. El análisis de 13 loci microsatélite indicó una alta diferenciación genética entre Faro y las localidades gallegas. La presencia de alelos privados en dos loci permite identificar las almejas de la localidad portuguesa. De los marcadores mitocondriales, sólo el CitB reveló diferenciación genética significativa entre algunas localidades (Barallobre-O Grove y Faro-O Grove). Los microsatélites se utilizaron también para realizar análisis de paternidades y evaluar los cambios genéticos que puede producir la obtención de semilla en criadero. Se estimó el tamaño efectivo de reproductores, que fue inferior al tamaño censal (reducción del 40%). El valor estimado predice un incremento de endogamia bajo (0,6 %) pero es insuficiente para evitar la pérdida de alelos a baja frecuencia. La reducción observada puede atribuirse en gran medida a la ausencia de contribución y a una contribución desigual de los reproductores, siendo las hembras las que mostraron mayor sesgo. La semilla de criadero se analizó tanto globalmente como segregada en grupos de tamaño (pequeña, mediana y grande) para evaluar los efectos de ésta práctica. Tanto el lote de reproductores como los progenitores identificados y el conjunto de la semilla presentaron valores de diversidad genética equivalentes a los de la localidad de origen de los reproductores. Pero la semilla pequeña mostró diferencias con la mediana y grande en varios parámetros genéticos, indicando que su uso individualizado en repoblación incrementaría el riesgo de impacto genético. En términos de estructura poblacional, la semilla producida mostró una diferenciación genética significativa pero baja respecto a las localidades analizadas. En general, la calidad genética de la semilla analizada es superior a la descrita en otros bivalvos. La adopción de estrategias que aumenten el número de reproductores y equilibren su contribución, especialmente de las hembras, hace prever que se pueda obtener semilla de calidad óptima para programas de repoblación con mínimo impacto genético.