Conservation genetics in threatened plants in NW Spaina practical approach

  1. López Pérez, Lúa
Supervised by:
  1. Rodolfo Barreiro Director

Defence university: Universidade da Coruña

Fecha de defensa: 29 July 2014

Committee:
  1. José Carlos Rubén Retuerto Franco Chair
  2. Manuel Pimentel Pereira Secretary
  3. Silvia Raquel Cardoso Castro Committee member
  4. José Gabriel Segarra Moragues Committee member
  5. Rosalía Piñeiro Portela Committee member
Department:
  1. Biology

Type: Thesis

Teseo: 368547 DIALNET lock_openRUC editor

Abstract

a adecuada gestión de plantas con especial interés para la conservación requiere conocer la magnitud y la distribución espacial de la diversidad genética, ya que estas especies a menudo presentan características que las hacen más susceptibles a la erosión genética. En este contexto, la presente tesis se centra en la aplicación de marcadores moleculares para la conservación de plantas raras y amenazadas. En los dos primeros capítulos se investiga la diversidad genética y la estructura de población del endemismo clonal Centaurea borjae empleando AFLPs y secuencias del genoma del cloroplasto. C. borjae mostró una diversidad genética intermedia-baja en comparación con otras plantas con rasgos vitales similares. El flujo genético está restringido, ya que poblaciones distanciadas unos cientos de metros presentaron diferencias significativas. La frecuencia de clones fue inferior a la esperada y parece estar relacionada con el tipo de suelo. Finalmente, se recomienda establecer cinco Unidades de Gestión y mantener una distancia >80 m entre individuos recogidos para conservación ex situ. A lo largo del tercer capítulo, se investiga la diversidad neutral y cuantitativa del terófito amenazado Omphalodes littoralis spp. gallaecica. Las cinco poblaciones existentes revelaron una diversidad genética neutral mínima o cero además de ausencia de flujo genético entre ellas. Mediante experiencias de trasplante recíproco, se encontraron diferencias entre poblaciones en varios caracteres cuantitativos pero dicha diferenciación no se ajustó a un patrón de adaptación local. Por contra, la variación fenotípica parecía ser consecuencia de la deriva genética. En base a los resultados genéticos y fenotípicos, cada población debe considerarse como una Unidad Evolutivamente Significativa independiente a efectos de conservación. El último capítulo se centra en desarrollar marcadores SSR para plantas amenazadas utilizando secuencias EST disponibles en bases de datos públicas. Se estudiaron 257 géneros y el 86% de ellos fueron analizados con éxito. Como la mayoría de estos géneros carecen de genomas anotados, Arabidopsis y Oryza se emplearon como controles para determinar la distribución de los EST-SSRs a lo largo del genoma. Dímeros y trímeros fueron los tipos de repeticiones más abundantes. Los genomas de control revelaron que los trímeros están distribuidos principalmente en regiones de codificantes, mientras que los dímeros se asocian mayoritariamente con regiones no codificantes. La tasa de amplificación fue buena. Además, fueron transferibles entre especies del mismo género.